Şiddetli aplastik anemisi olan hastalarda siklofosfamid(Cy) ve antitimosit globulin(ATG) şartlandırma rejimi çeşitli çalışmalarda araştırılmıştır. Ciddi aplastik anemi(sAA) için allojenik kemik iliği naklinin(AKİT) sonuçları genellikle çok iyidir. sAA'da AKİT sırasında karşılaşılan en büyük zorluklar greft başarısızlığı ve GvHD'dir. sAA'daki AKİT, yüksek oranda greft reddi ile ilişkilidir(%10; %5 ila 15 aralığında) ve bu transplantasyondan önceki hastalık süresi ve transfüzyon sayısı ile ilişkilidir. Şiddetli akut GvHD, hastaların %30-40'ında yaygın kronik GvHD görülmesine ve yaşam kalitesi, ikinci maligniteler ve mortalite üzerinde önemli bir etkiye sahip olmasına rağmen nadirdir. Donör-alıcı cinsiyet uyumsuzluğu GvHD'yi ve greft başarısızlığını etkiler ancak ATG kullanımı cinsiyet uyumsuzluğunun olumsuz etkisini ortadan kaldırır.